卷丹百合的分株最好在早春二、三月土壤解冻后进行。将母株从花盆内取出，把多余的盆土抖掉，尽可能地将盘杂在一起的根系分开，用刀子把它剖成两株或两株以上，每一株都要带有相当的根系，叶片也要进行适当地修剪，以利于卷丹百合的成活。

将分株的卷丹百合进行消毒，使用百菌清1500倍液，在其中浸泡五分钟，然后将其取出晾干，即可上盆。或者可以在上盆后立刻用百菌清灌根。

分株装盆后灌根或浇一次透水。因为其根系受到损伤，吸水能力非常弱，所以需要3～4周左右才能恢复萌发新根，所以在分株后3～4周内浇水要有节制，以免其根部溃烂。但卷丹百合的叶片蒸腾没有受到影响，需要每天对叶面喷雾1～3次，使水分保持在平衡状态 。这期间不要浇肥，不要暴晒，可以放在遮荫棚内养护。

小苗装盆时，先在盆底放入2厘米厚的陶粒或者粗粒基质作为滤水层，在上面撒上一层腐熟的有机肥料作为基肥，约为1～2厘米厚，再盖上一层基质，约1～2厘米厚，再放入植株，把肥料与根系分开，避免烧根。上盆后需要浇一次透水，并放在稍微荫蔽的环境里养护一周。

小苗进行移栽时，需要挖好种植穴并在其底部撒一层有机肥作底肥，大约4～6厘米厚，再覆一层土并放入苗木，避免烧根。放入苗木后，需要对土壤进行回填，将根系覆盖住，用脚把土壤踩实，浇一次透水。